典型的反相鍵合固定相色譜儀是采用非極性鍵合固定相和極性流動相組成的色譜體系，固定相常用十八烷基（ODS或C₁₈）鍵合固定相，流動相常用甲醇－水或乙腈－水。非典型反相鍵合固定相色譜儀是采用弱極性或中等極性鍵合固定相和極性大于固定相的流動相組成的色譜體系。

疏溶劑理論把非極性烷基鍵合固定相看作是在硅膠表面上覆蓋了一層鍵合的十八烷基的分子毛，分子毛具有強疏水特性。當用水和有機溶劑組成的極性溶劑為流動相分離有機化合物時，一方面，非極性組分分子或組分分子的非極性部分，由于疏溶劑作用將會從水中被“擠”出來，與固定相上的疏水烷基產生締合作用，使組分分子在固定相上得到保留。另一方面，被分離物的極性部分受到極性流動相的作用而離開固定相，保留值減小，此即解締過程。這兩種作用力之差決定了組分分子在色譜中的保留行為。

一般來說，固定相上的烷基配合基或組分分子中非極性部分的表面積越大或流動相表面張力和介電常數(shù)越大，締合作用越強，分配比k越大，保留值越大。在反相鍵合固定相色譜中，極性大的組分先流出，極性小的組分后流出。

   

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