影響高效毛細管電泳儀分離效果的因素有電場強度、緩沖液pH、離子強度、溫度和添加劑等。

一、電場強度：

1、結果：

電滲速度與電場強度成正比。

2、說明：

（1）電場強度降低，分離效率和分辨率降低。

（2）電場強度增大，焦耳熱增大。

二、緩沖液pH：

1、結果：

pH增大，電滲速度增大。

2、說明：

（1）改變電滲速度最方便有用的方法。

（2）可能會引起組分電荷和結構改變。

三、離子強度（緩沖液濃度）：

1、結果：

離子強度增大，Zeta電位降低，電滲速度降低。

2、說明：

（1）離子強度增大，電流和焦耳熱增大。

（2）離子強度低，可能存在樣品吸附問題。

（3）導電性與樣品不同，可能引起峰形畸變。

（4）離子強度低，樣品裝載量小。

四、溫度：

1、結果：

溫度每改變1℃，溶液粘度變化約2%～3%。

2、說明：

溫度由儀器自動控制，常用方法。

五、添加劑：

1、結果：

（1）加入濃度較大的中性鹽如K2SO4，離子強度增大，電滲速度降低。

（2）加入表面活性劑，可改變電滲速度的大小和方向。某些陽離子表面活性劑使電滲速度降低，某些陰離子表面活性劑如十二烷基硫酸鈉（SDS），可使壁表面負電荷增加，電滲速度增大。

（3）加入有機溶劑如甲醇和乙腈，使溶液粘度減小，電滲速度增大。

2、說明：

變化復雜，其影響應通過實驗測定，可能改變選擇性。

   

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